Изучение возможности параллелизации метода группового учета аргументов в решении задач QSAR с применением графических ускорителей на платформе OPENCL

Кумсков, М.И.; Локтев, Д.К.; Васильева, В.О.

Авторы: Кумсков М.И., Локтев Д.К., Васильева В.О.
Журнал: Pattern Recognition and Image Analysis: Advances in Mathematical Theory and Applications
Том: 34
Год издания: 2024
Издательство: Pleiades Publishing, Ltd
Местоположение издательства: Road Town, United Kingdom
Аннотация: В работе рассмотрены основные проблемы решения задачи QSAR задачи (Quantitative Structure-Activity Relationship) как задачи прогнозирования биологической активности органических соединений. В качестве одного из способов решения данной задачи рассматриваются Метод Группового Учета Аргументов(МГУА) и МГУА-подобные алгоритмы, которые позволяют использую матрицу-дескриптор для молекулы и вектор с целевым свойством, которое необходимо спрогнозировать, построить модель, которая позволит с достаточной точностью спрогнозировать целевое свойство нового соединения. Большинство МГУА и МГУА подобных алгоритмов обладают качественным недостатком – они крайне требовательны к вычислительным возможностям и обладают высокой комбинаторной сложностью, что значительно увеличивает время необходимое на построение модели. Целью работы является изучение возможности оптимизации процесса построения модели путем распределения задачи построения на несколько вычислительных устройств, в том числе гетерогенных. Реализовано данное распараллеливание было на языке C/C++ с применением технологии OpenCL. В результате работы, было разработано программное обеспечение и проведены вычислительные эксперименты, показывающие, что при применении графических ускорителей в решении задачи QSAR возможно значительно сократить время необходимое на вычисления.Работа выполнена в рамках научно-образовательной школы МГУ «Мозг, когнитивные системы, искусственный интеллект».
Добавил в систему: Кумсков Михаил Иванович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ЦЭМИ РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ЦЭМИ РАН

Изучение возможности параллелизации метода группового учета аргументов в решении задач QSAR с применением графических ускорителей на платформе OPENCLстатья

Прикрепленные файлы