|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ЦЭМИ РАН |
||
Вариационные принципы в механике конформационных движений макромолекул в вязкой средестатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАКСтатья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 октября 2018 г.
- Автор: Шайтан К.В.
- Журнал: Биофизика
- Том: 63
- Номер: 1
- Год издания: 2018
- Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 5
- Последняя страница: 15
- Оригинальные версии: Variational Principles in the Mechanics of Conformational Motions of Macromolecules in a Viscous Medium
- Аннотация: Рассматривается механика конформационных движений макромолекул за счет поворотов вокруг валентных связей в вязкой среде. Анализируется выполнение вариационных принципов для скорости диссипации энергии (ДЭ) при конформационных движениях в вязкой среде и скорости уменьшения потенциальной энергии (ПЭ) макромолекулы при конформационной релаксации. Условие равенства скорости ДЭ и скорости убывания ПЭ приводит к выполнению принципа максимума скорости убывания ПЭ системы. Решается кажущийся парадокс противоречия этого принципа и принципа минимума скорости ДЭ. Показано, что скорость ДЭ должна быть оптимальной и минимальной для одновременного обеспечения законов сохранения и выполнения условий детерминизма для классических траекторий. Проведено обобщение и анализ влияния тепловых флуктуаций и внешних сил на выполнение вариационных принципов для конформационной релаксации макромолекул. Развиты наглядные геометрические представления на языке гиперсфер в пространстве скоростей узлов цепи для описания конформационных движений по многим степеням свободы в вязкой среде. Обсуждается равномерность распределения скоростей ДЭ (и скоростей уменьшения ПЭ) по конформационным степеням свободы. Ключевые слова: конформационная подвижность, динамика макромолекул, уравнения Ланжевена, вариационные принципы механики, многомерная геометрия, скорость диссипации энергии, принцип минимума скорости диссипации энергии, принцип максимума скорости уменьшения потенциальной энергии, фолдинг, влияние вязкости на динамику макромолекул
- Добавил в систему: Шайтан Константин Вольдемарович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | пдф | 1-shaytan.pdf | 362,0 КБ | 24 февраля 2018 [ShaitanKV] |