СТРУКТУРА G-КВАДРУПЛЕКСНОГО ДНК-АПТАМЕРА К ТРОМБИНУ RA36статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 16 февраля 2016 г.
Аннотация:Изучена структура 31-звенного аптамерного олигонуклеотида (RA36), более эффективно
ингибирующего коагулянтную активность тромбина по сравнению с широкоизвестным
аптамером 15TGT (Thrombin binding aptamer). Аптамер RA36 имеет двухмодульную
структуру, в состав которой входят две G-богатых области, способные формировать
квадруплекс. Методом кругового дихроизма показано, что аптамер RA36 формирует
G-квадруплекс, аналогичный G-квадруплексу 15ТGT. Изучена термическая стабильность
G-квадруплекса RA36. При физиологических условиях (концентрация стабилизирующего
катиона 5 мМ) температура плавления G-квадруплексов RA36 значительно ниже, чем
15TGT. Спектры КД делеционных мутантов этого олигонуклеотида подтверждают двух-
модульное строение RA36, т.е. образование G-квадруплекса в структуре аптамера RA36
как первым, так и вторым G-богатым участком.