Аннотация:Формирование белками гистонами и участками молекулы ДНК компактных образований – нуклеосом способствует не только упаковке молекулы ДНК в ядре клетки, но и играет важную роль в регуляции процессов транскрипции и экспрессии генов. В ходе работы созданы молекулярно-механические модели нуклеосом и их составляющих в явном растворителе, для которых настроена возможность проведения суперкомпьютерного моделирования методом молекулярной динамики с использованием параллельных технологий по методу декомпозиции области. Проведен ряд рекордных молекулярно-динамических расчетов со временем моделирования до 1 микросекунды. Исследована крупномасштабная конформационная подвижность нуклеосом, а также отдельно гистонов и ДНК, с помощью методов ковариационного анализа отклонений координат атомов. Исследован процесс разворачивания ДНК при потере нуклеосомой H2A-H2B димера. Получена атомистическая модель структуры гексасомы.